【佳學(xué)基因檢測】染色體微陣列芯片技術(shù)與產(chǎn)前基因檢測
根據(jù)《產(chǎn)前診斷基因檢測技術(shù)的發(fā)展歷程》,從20世紀(jì)60年代中期開始分子診斷機(jī)開始提供染色體異常的產(chǎn)前診斷。在過去超過50年的大部分時間里,胎兒的細(xì)胞遺傳學(xué)檢測都是通過標(biāo)準(zhǔn)G帶核型分析完成的。使用常規(guī)核型細(xì)胞遺傳學(xué)分析的診斷率取決于適應(yīng)癥。對于最常見的適應(yīng)癥,如高齡產(chǎn)婦和生化篩查陽性,CVS和羊膜穿刺術(shù)時的診斷率分別約為6%和3%。來自NICHD微陣列數(shù)據(jù)集的佳學(xué)基因分析數(shù)據(jù)。對于具有結(jié)構(gòu)異常的胎兒,診斷率在前三個月約為49%,在后三個月為17%。
較新的分子細(xì)胞基因組檢測技術(shù)的出現(xiàn),如染色體微陣列分析(CMA)基因檢測,帶來了獲得更高診斷分辨率的希望。CMA基因檢測可以檢測千堿基范圍內(nèi)的不平衡,很容易證明其優(yōu)于標(biāo)準(zhǔn)核型分析,標(biāo)準(zhǔn)核型僅限于大于700-1000萬堿基的不平衡。在先天畸形、發(fā)育遲緩或智力殘疾兒童的出生后研究中,CMA對臨床相關(guān)亞染色體異常的額外診斷率約為12%至15%。2013年,Wapner及其同事發(fā)表了一項由NICHD贊助的大型多中心研究,證明了CMA在產(chǎn)前診斷中的臨床應(yīng)用。前瞻性隊列研究表明,在胎兒結(jié)構(gòu)異常和核型正常的妊娠中,診斷率比核型檢測結(jié)果高出約6%。對于所有其他疾病,這約為1.7%。
CMA通過檢測DNA拷貝數(shù)的不平衡來發(fā)揮作用。這些不平衡被稱為拷貝數(shù)變異(CNV),其本身并不意味著異常或致病表型。事實上,大量的CNV在臨床上并不重要,并且在明顯正常的個體中發(fā)現(xiàn)。這些“良性”CNV中的大多數(shù)非常小(<50kb),沒有臨床上有意義的編碼區(qū)。CNV通常被稱為微缺失(亞顯微丟失)或微重復(fù)(亞顯微結(jié)構(gòu)增加),常規(guī)核型無法檢測到。CNV的醫(yī)學(xué)相關(guān)性與微缺失/復(fù)制的功能影響有關(guān),當(dāng)關(guān)鍵基因或重要調(diào)控區(qū)域出現(xiàn)不平衡時,微缺失/重復(fù)更有可能產(chǎn)生表型效應(yīng)。
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