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【佳學(xué)基因檢測(cè)】單基因病的胚胎植入前基因檢測(cè)(PGT-M)

【佳學(xué)基因檢測(cè)】單基因病的胚胎植入前基因檢測(cè)(PGT-M) 用于單基因疾病的PGT(PGT-M)最初設(shè)計(jì)用于出生時(shí)出現(xiàn)的單基因疾病,如囊性纖維化和X連鎖疾病,最初似乎不實(shí)用,應(yīng)用非常有限,導(dǎo)

佳學(xué)基因檢測(cè)】單基因病的胚胎植入前基因檢測(cè)(PGT-M)



用于單基因疾病的PGT(PGT-M)最初設(shè)計(jì)用于出生時(shí)出現(xiàn)的單基因疾病,如囊性纖維化和X連鎖疾病,最初似乎不實(shí)用,應(yīng)用非常有限,導(dǎo)致在應(yīng)用的頭幾年僅出生了幾個(gè)嬰兒。此外,報(bào)告了幾例誤診,這是由于先前未知的優(yōu)先擴(kuò)增現(xiàn)象或等位基因特異性擴(kuò)增失敗(等位基因缺失ADO),需要制定一種特殊的方案來(lái)高效檢測(cè)。

ADO的高發(fā)生率可能明顯導(dǎo)致誤診,特別是在復(fù)合雜合子胚胎中,因此PGT-M的高效性取決于檢測(cè)ADO的能力,ADO的檢測(cè)能力似乎隨著不同的裂解程序、細(xì)胞類型以及可能分析的位點(diǎn)而變化。因此,設(shè)計(jì)一種高效的檢測(cè)潛在ADO的方法,作為避免PGT-M誤診的有效工具,具有重要意義。該方法的主要原理是通過(guò)在第一輪PCR中引入突變基因和多態(tài)性標(biāo)記的所有外部引物的混合物,同時(shí)擴(kuò)增致病基因和連鎖多態(tài)性標(biāo)記。然后用第二輪PCR中每個(gè)位點(diǎn)的特異性內(nèi)部引物,以更高的嚴(yán)格度擴(kuò)增第一輪PCR的PCR產(chǎn)物的單獨(dú)等分試樣。這種雙重或多重放大允許檢測(cè)大多數(shù)ADO發(fā)生。因此,多重?cái)U(kuò)增允許檢測(cè)ADO作為防止移植誤診胚胎的手段。每增加一個(gè)連鎖標(biāo)記可以將誤診率降低一半,因此,如果一個(gè)連鎖標(biāo)志與突變一起擴(kuò)增,誤診率可能從20%降至10%,兩個(gè)從10%降至5%,三個(gè)從5%降至幾乎為零。只有當(dāng)多態(tài)位點(diǎn)和突變一致時(shí),胚胎才被移植。因此,多重?cái)U(kuò)增可以檢測(cè)ADO并防止移植被誤診的受影響胚胎。

目前,檢測(cè)ADO的重要性似乎更為重要,WGA被廣泛用作PGD-M的第一步,因?yàn)閃GA可顯著提高所有類型活檢細(xì)胞的ADO率。即使轉(zhuǎn)移到囊胚活檢,允許檢測(cè)多達(dá)5個(gè)細(xì)胞,WGA后ADO率幾乎翻了一番,因此增加了誤診的風(fēng)險(xiǎn)。然而,通過(guò)在WGA后的新穎PGT-M系統(tǒng)經(jīng)驗(yàn)中應(yīng)用上述方法,在PGD-M中未觀察到誤診,盡管設(shè)計(jì)更有效的WGA程序以有效避免與WGA相關(guān)的潛在ADO仍然是一個(gè)真正的挑戰(zhàn)。另一種方法是多重位移放大(MDA),它用于核定位,然而,它仍然易于ADO。WGA和MDA的現(xiàn)有經(jīng)驗(yàn)表明,ADO仍可能導(dǎo)致誤診,需要特定的個(gè)性化PGT設(shè)計(jì),這也是基于世界上最大系列PGT-M的經(jīng)驗(yàn)。

值得注意的是,為每對(duì)夫婦制定特殊的PGT-M設(shè)計(jì)仍需要準(zhǔn)備工作,這可能還涉及建立父系單倍型所需的單個(gè)精子分型,因此除了突變測(cè)試外,還可以進(jìn)行更有效的連鎖標(biāo)記分析,這對(duì)于父系顯性條件的PGT尤為重要。目前,在不進(jìn)行直接突變測(cè)試的情況下對(duì)PGT-M進(jìn)行單體型分析是一種更普遍的方法,也稱為“植入前遺傳單體型分析”(PGH)。親本單倍型的可用性不僅可以確認(rèn)突變基因的缺失,還可以確認(rèn)PGT-M中母系和父系野生等位基因的存在。這種方法也有局限性,因?yàn)榧议L(zhǎng)分析并不總是可用的。

最近引入的核定位方法也是為PGD-M設(shè)計(jì)的,不需要測(cè)試致病基因,也有一個(gè)組合的PGT-a。然而,核定位并不是普遍適用于每一個(gè)PGT-M病例,例如父母雙方都無(wú)法進(jìn)行分析,或者兩人在高度血緣背景下都具有相同的隱性突變,或者請(qǐng)求PGT-M的患者中有一人具有從頭突變(DNM),這代表了該方法的重要局限性。生殖遺傳學(xué)基因檢測(cè)的臨床數(shù)據(jù)分析了2780對(duì)夫婦的PGT-M系列的結(jié)果,結(jié)果表明,染色體定位可能不適用于多達(dá)三分之一的涉及PGT-M的家庭。由于PGH和細(xì)胞核定位都需要在應(yīng)用于PGT周期之前進(jìn)行家族研究以建立聯(lián)系,因此需要潛在父母的一級(jí)親屬的可用性以及家族成員中家族疾病相關(guān)DNA變異的直接分析。

在父母或患病兒童中檢測(cè)到的DNM的PGT中,特殊家族設(shè)計(jì)的發(fā)展尤為重要,因?yàn)闊o(wú)論是起源還是相關(guān)的單倍型都無(wú)法用于追蹤從胚胎或卵母細(xì)胞活檢的單個(gè)或多個(gè)細(xì)胞中DNM的遺傳。越來(lái)越多的夫婦在沒(méi)有任何遺傳病家族史的情況下申請(qǐng)PGT-M,因?yàn)檫@是在父母之一或患病的孩子身上新穎診斷出來(lái)的。這包括在PGT前對(duì)父母和患病兒童進(jìn)行DNA分析,包括突變驗(yàn)證、多態(tài)性標(biāo)記評(píng)估、建立正常和突變單倍型的完整和單精子測(cè)試,以及通過(guò)極體分析和/或胚胎活檢進(jìn)行PGD。盡管策略可能因DNM遺傳類型而異,但一般方法包括確定DNM起源,并尋找可能的性腺嵌合體和相關(guān)的親本單倍型。其中一個(gè)重要步驟是單精子分型,以排除可能的性腺嵌合體。即使未鑒定出DNM,單精子分型也可能鑒定出一種“良性”突變單倍型,即不含DNM的突變單體型。另一項(xiàng)重要要求是確定父母雙方的相關(guān)關(guān)聯(lián)MARkers,即使只有一方是DNM攜帶者。雖然并非總是可行,但通過(guò)PB進(jìn)行PGD檢測(cè)或確認(rèn)母體正常和突變單倍型始終是先進(jìn)方法。

在涉及母系和父系顯性、隱性或X連鎖DNM的大系列中,新穎對(duì)DNM進(jìn)行系統(tǒng)的PGT,證明這些家庭的PGT-M策略取決于DNM的父母來(lái)源,并包括在PGT之前對(duì)父母和受影響兒童進(jìn)行廣泛的DNA分析。這涉及突變驗(yàn)證、多態(tài)性標(biāo)記評(píng)估、全精子和單精子測(cè)試或PB分析,以建立正常和突變單倍型,如前所述,沒(méi)有這些單倍型就無(wú)法進(jìn)行DNM的PGT。盡管針對(duì)DNM的PGT非常復(fù)雜,但應(yīng)用的策略似乎非常正確,這使其成為PGT-M實(shí)踐的有益補(bǔ)充,可以提供給任何有風(fēng)險(xiǎn)的夫婦,而不管家庭數(shù)據(jù)是否可用。

盡管PGD-M仍然主要針對(duì)特定疾病進(jìn)行設(shè)計(jì),但也使用了一種綜合方法來(lái)同時(shí)測(cè)試兩個(gè)或多個(gè)疾病,還結(jié)合了染色體異倍性和易位的伴隨測(cè)試。請(qǐng)閱讀佳學(xué)基因相關(guān)內(nèi)容以做更為詳細(xì)的了解。

(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)
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