【佳學基因檢測】產(chǎn)前診斷中超聲檢查正常胎兒的CMA基因檢測
與傳統(tǒng)的細胞遺傳學和FISH技術相比,使用CMA進行染色體異常的產(chǎn)前遺傳學診斷的最大優(yōu)勢在于CMA能夠檢測到更小的失衡。通過G顯帶進行的典型核型分析可能能夠檢測出大小為5-10 Mb的缺失和重復。然而,考慮到從一次產(chǎn)前檢測準備到下一次產(chǎn)前檢測的顯帶分辨率差異,10-20 Mb及以上是常規(guī)核型分析更現(xiàn)實的檢測閾值。微缺失/重復綜合征的標準FISH通常針對100-200kb范圍內(nèi)的失衡,但需要臨床特征來指導探針選擇,這對于產(chǎn)前樣本來說是一項具有挑戰(zhàn)性的任務。可以采用多重FISH探針,但可同時用于檢測多種疾病的具有特定光譜獨特熒光標記探針的數(shù)量有限,僅限于少數(shù)。為了提高診斷率,可以對許多FISH探針以次檢測,但這樣做效率低、耗時且非常昂貴。CMA可以在單個測試中檢測基因組中任何地方的亞微觀失衡(<5 Mb),其分辨率僅受芯片上存在的探針的限制。與核型相比,CMA在識別產(chǎn)前標本中常見的非整倍體方面的正確率為100%。在NICHD研究中,它證明了在晚期產(chǎn)婦、父母焦慮和陽性血清篩查患者中,診斷率比標準核型1.7%。最近一項薈萃分析評估了10項大型研究中的10614個胎兒的CMA,在AMA和父母焦慮癥患者中,有臨床意義的CNV為0.84%(1:119)。
最近的一項薈萃分析評估了CMA診斷的基因組疾病的發(fā)病率/外顯率。來自8項大型研究的10314名胎兒顯示,與早發(fā)綜合征相關的CNV發(fā)生在1:270(0.37%)的妊娠中。約1:909(0.11%)的病例涉及晚發(fā)性疾病,1:333(0.3%)的病例觀察到CNV易感性。通過將致病性CNV的個體風險與細胞遺傳學可見染色體畸變的個體風險相加,Srebniak及其同事表明,總體而言,孕婦發(fā)生臨床顯著細胞遺傳學畸變的風險高于1:180。此外,36歲以下的孕婦具有致病性CNV的風險高于唐氏綜合征。
在通過超聲探測沒有發(fā)現(xiàn)異常的胎兒中,采用CMA基因檢測檢出的陽性率與核型分析的檢出率相比,在不同的研究中呈現(xiàn)出相當大的變異性。早期的一項大型系統(tǒng)評價顯示,CMA基因檢測有1%的病例具有臨床上意義的檢測結果,而單項研究中,這一比例低至0.4%,另一項研究檢出率高達2.0%。這種差異可能是由于使用的陣列平臺、使用的陣列分辨率以及每個臨床實驗室報告實踐的差異。當然,特定結果致病性的因實驗室而異,而這些定義也隨著時間的推移而變化。隨著新的知識和公共數(shù)據(jù)庫中共享結果的增加,與疾病在確定性關系的基因組區(qū)域數(shù)量增加,顯著性不確定的變異(VUS)的發(fā)生率隨著時間的推移而降低。例如,最初的NICHD研究報告,致病性CNV和VUS的發(fā)生率分別為0.9%和2.5%。根據(jù)新的文獻和公共數(shù)據(jù)庫,每年對同一數(shù)據(jù)集的審評,使得致病性病例增加到1.8%,而意義未明(VUS)病例減少到0.9%。
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