【佳學(xué)基因檢測(cè)】熒光原位雜交(FISH)在實(shí)體瘤診斷和個(gè)體化治療中的應(yīng)用

熒光原位雜交基因檢測(cè)導(dǎo)讀：

熒光原位雜交(FISH)是一種重要的分子病理學(xué)檢測(cè)技術(shù),通過使用熒光標(biāo)記的DNA探針與組織或細(xì)胞中的特定基因或染色體區(qū)域雜交,可以檢測(cè)基因的數(shù)目、結(jié)構(gòu)和位置等異常情況。

在實(shí)體瘤診斷方面,FISH技術(shù)主要用于:

鑒別腫瘤的類型和亞型,如通過檢測(cè)特定的基因重排(如EWSR1-FLI1在Ewing肉瘤中)進(jìn)行分型。

評(píng)估預(yù)后相關(guān)的分子標(biāo)志物,如HER2基因擴(kuò)增在乳腺癌中與較差預(yù)后相關(guān)。

檢測(cè)腫瘤特征性的染色體異常,如慢性骨髓性白血病的費(fèi)城染色體。

在個(gè)體化治療方面,FISH檢測(cè)結(jié)果可以指導(dǎo)靶向藥物的選擇:

檢測(cè)驅(qū)動(dòng)基因的擴(kuò)增或者過度表達(dá),如EGFR、HER2等,可用于選擇相應(yīng)的小分子靶向藥物或單克隆抗體。

檢測(cè)基因重排,如ALK、ROS1等,可用于選擇相應(yīng)的酪氨酸激酶抑制劑。

檢測(cè)抗腫瘤藥物靶點(diǎn)的狀態(tài),如TOPO2A基因擴(kuò)增可用于預(yù)測(cè)對(duì)蒽環(huán)類藥物的反應(yīng)。

綜上所述,FISH技術(shù)為實(shí)體瘤的分子分型診斷和靶向治療藥物的正確使用提供了重要的分子依據(jù),是現(xiàn)代正確腫瘤學(xué)不可或缺的分子病理檢測(cè)手段。

熒光原位雜交（FISH）是基因異常常規(guī)診斷中的標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)

熒光原位雜交（FISH）是基因異常常規(guī)診斷中的標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)。由于FISH操作簡單，佳學(xué)基因腫瘤基因檢測(cè)可以識(shí)別腫瘤特異性異常。其應(yīng)用僅限于設(shè)計(jì)的探針類型?；蛑嘏?，例如ALK、ROS1反映多個(gè)易位伙伴，關(guān)鍵區(qū)域的缺失，例如1p和19q，基因融合，例如COL1A1-PDGFB，基因組失衡，例如6p、6q、11q和擴(kuò)增，例如HER2，是個(gè)性化腫瘤學(xué)的目標(biāo)。遺傳標(biāo)記的確認(rèn)通常是開始特定、靶向治療的直接指標(biāo)。在其他情況下，檢測(cè)到的異常有助于病理學(xué)家更好地區(qū)分軟組織肉瘤，或作出賊終診斷。佳學(xué)基因的主要目標(biāo)是表明，將FISH應(yīng)用于福爾馬林固定石蠟包埋組織樣本（FFPE）可以評(píng)估來自原發(fā)性腫瘤或轉(zhuǎn)移瘤的細(xì)胞群中的基因組狀態(tài)。盡管有許多更先進(jìn)的技術(shù)可供使用，例如實(shí)時(shí)PCR或新一代測(cè)序，但FISH仍然是許多遺傳實(shí)驗(yàn)室中常用的方法。

熒光原位雜交(FISH)在實(shí)體瘤診斷和個(gè)體化治療中的應(yīng)用關(guān)鍵詞

ALK；COL1A1-PDGFB；FISH；HER2；ROS1；個(gè)性化醫(yī)學(xué)；個(gè)性化腫瘤學(xué)；t（X，18）；靶向治療。

佳學(xué)基因是如何理解熒光原位雜交技術(shù)的？

原位雜交篩查在個(gè)性化醫(yī)學(xué)中起到支持作用。多種已知的異?，F(xiàn)象，包括由易位、插入或倒位導(dǎo)致的重排、缺失（刪除）和增益（例如擴(kuò)增），主要可以通過熒光原位雜交（FISH）來評(píng)估。在某些情況下，色原原位雜交（CISH）也被引入到分子病理學(xué)和分子腫瘤學(xué)領(lǐng)域。兩種原位雜交方法都基于相同的原理，即與感興趣的區(qū)域進(jìn)行退火、檢測(cè)、評(píng)估和空間定位。這兩種方法的主要區(qū)別在于基因組區(qū)域的標(biāo)記方法，可以使用生物素或地高辛（CISH），或者使用熒光標(biāo)記（FISH），然后使用適當(dāng)?shù)臋z測(cè)系統(tǒng)。對(duì)于用生物素標(biāo)記的探針，使用與辣根過氧化物酶（HRP-鏈霉親和素）結(jié)合的鏈霉親和素進(jìn)行檢測(cè)。對(duì)于帶有地高辛的探針，使用抗地高辛熒光素一抗，隨后使用與熒光素結(jié)合的HRP二抗，并在明場顯微鏡下計(jì)數(shù)信號(hào)。FISH檢測(cè)是直接進(jìn)行的，需要熒光顯微鏡。遺傳標(biāo)記的檢測(cè)通常在患者決策中起到關(guān)鍵作用，從患者風(fēng)險(xiǎn)分層到實(shí)施適當(dāng)?shù)闹委?。這兩種原位技術(shù)都用于該領(lǐng)域。例如，與FISH相比，CISH在檢測(cè)HER-2/neu基因擴(kuò)增方面的靈敏度為97.5%，特異性為94%。在一組4460例乳腺癌患者的FISH和CISH結(jié)果的一致性率為96%，表明CISH是一種與FISH相當(dāng)?shù)募夹g(shù)。大多數(shù)資料都認(rèn)為，在基因擴(kuò)增檢測(cè)中，F(xiàn)ISH和CISH的表現(xiàn)幾乎相同。然而，由于17號(hào)染色體的多體性，CISH對(duì)于低水平擴(kuò)增的靈敏度可能較低。對(duì)于使用FISH和CISH檢測(cè)的ALK（ALK受體酪氨酸激酶）重排，也有類似的觀察結(jié)果。在對(duì)449個(gè)樣本的測(cè)試中，這兩種方法分別顯示出19個(gè)和18個(gè)ALK陽性樣本。CISH的靈敏度為94.4%，特異性為100%。雖然每種診斷工具，不僅基于雜交，還基于蛋白質(zhì)表達(dá)，如免疫組織化學(xué)（IHC），都有其優(yōu)點(diǎn)和缺點(diǎn)，但FISH技術(shù)目前被認(rèn)為是參考方法。

原位檢測(cè)的另一替代方法是使用mRNA作為生物標(biāo)志物。該技術(shù)使用與測(cè)試的mRNA分子互補(bǔ)的單鏈DNA探針。標(biāo)準(zhǔn)程序包括消化、雜交、使用抗地高辛抗體和標(biāo)記有HRP的二抗進(jìn)行檢測(cè)，以及使用顯色劑（例如DAB，即3,3'-二氨基聯(lián)苯胺）和明場顯微鏡對(duì)結(jié)果進(jìn)行可視化。與上述ISH技術(shù)相比，mRNAISH更快、更便宜、制備更容易且毒性更低?？梢允褂眉从眯驮噭┖袑?duì)福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）樣本中的乳腺癌HER2基因表達(dá)進(jìn)行評(píng)估。與其他基于mRNA評(píng)估的技術(shù)一樣，其主要限制是核糖核酸的穩(wěn)定性較差。