【腫瘤靶向藥物基因檢測(cè)】talazoparib 在具有體細(xì)胞BRCA2致病性突變的激素受體陽(yáng)性HER2陰性轉(zhuǎn)移性乳腺癌女性中的治療效果
腫瘤藥物他拉唑帕尼(talazoparib)基因檢測(cè)導(dǎo)讀:
下一代測(cè)序 (NGS) 已被證明是全面了解癌癥患者體內(nèi)發(fā)病原因和治療手段的關(guān)鍵措施實(shí)施。 在日常實(shí)踐中,通過(guò)腫瘤正確治療850基因檢測(cè),可以獲得體細(xì)胞和種系突變的鑒定,使醫(yī)生能夠收集相關(guān)信息來(lái)做出治療決策并使患者受益。 重要的是,體細(xì)胞突變?yōu)橹委熖峁┝擞嗅槍?duì)性的機(jī)會(huì),并揭示了了解患者腫瘤演變的耐藥機(jī)制。 關(guān)于聚(ADP-核糖)聚合酶抑制劑的選擇需要獲得在致病性或可能致病性體細(xì)胞乳腺癌基因 1/2 (BRCA1/2) 突變和/或種系或 晚期乳腺癌 (ABC) 中的體細(xì)胞同源重組相關(guān)基因突變的數(shù)據(jù)。佳學(xué)基因檢測(cè)腫瘤正確用藥病案集收集了一名 47 歲絕經(jīng)后婦女的真實(shí)案例,她患有激素受體陽(yáng)性(HR 陽(yáng)性)表皮生長(zhǎng)因子受體 2(HER2)陰性轉(zhuǎn)移性 BC,對(duì) HR+/ 的經(jīng)典治療策略反應(yīng)不佳 HER2-ABC。 腫瘤醫(yī)院決定了使用 NGS 指導(dǎo)治療的可能性,并且患者對(duì)靶向非胚系 BRCA2 突變的他拉唑帕尼產(chǎn)生了明顯的治療效果。
為什么要開(kāi)展腫瘤正確用藥基因檢測(cè)?
在所有診斷為乳腺癌 (BC) 的患者中,通過(guò)腫瘤正確用藥850基因檢測(cè),大約 5%–10% 具有種系乳腺癌基因 1/2 (BRCA1/2) 突變。 這些蛋白質(zhì)通過(guò)在同源重組修復(fù)中整合 DNA 雙鏈損傷修復(fù)的復(fù)雜機(jī)制,在細(xì)胞存活中發(fā)揮重要作用。 這些基因中的四個(gè)突變具有高度滲透性,使 BRCA1 突變患者的乳腺癌 (BC) 終生風(fēng)險(xiǎn)增加高達(dá) 70%,使 BRCA2 突變患者的終生風(fēng)險(xiǎn)增加 40%–70%。
采用腫瘤正確用藥治療850的臨床醫(yī)生在具有這些種系突變的患者中探索了靶向治療,包括 DNA 損傷劑,例如聚(ADP-核糖)聚合酶抑制劑 (PARPi),以及參與單鏈 DNA 鏈斷裂修復(fù)的酶。
BRCA1/2 僅在 10% 的晚期 BC (ABC) 患者中被發(fā)現(xiàn)為體細(xì)胞突變。 這些體細(xì)胞 BRCA 突變未被充分認(rèn)識(shí),并且使很多有可能獲得有效治療的患者錯(cuò)失了額外靶向治療的機(jī)會(huì)。 基于兩項(xiàng)關(guān)鍵的 III 期臨床試驗(yàn),奧拉帕尼和他拉唑帕尼目前被批準(zhǔn)用于具有種系 BRCA1/2 突變和晚期乳腺癌 (ABC) 的患者。佳學(xué)基因腫瘤正確用藥探索性效果病案集收錄了一份關(guān)于 PARPi 在 BRCA2 體細(xì)胞突變患者中用于 HR+/Her2- ABC 的臨床效用的真實(shí)案例報(bào)告,通過(guò)該案例,探討對(duì)該類(lèi)患者采用腫瘤基因850正確用藥基因檢測(cè)的正反兩方面的看法。
晚期乳腺癌正確用藥基因檢測(cè)病例介紹
一位 47 歲的絕經(jīng)后婦女,其母親在 73 歲時(shí)有乳腺癌 (BC) 家族史(圖 1),其姑姑同時(shí)患有雙側(cè)乳腺癌 (BC) ,被診斷為原發(fā)性右側(cè)乳腺癌 (BC) ,激素受體陽(yáng)性(HR+), HER2 陰性,臨床 2A 期 (pT2pN1M0)。 2010年11月,進(jìn)行了保守手術(shù)和腋窩淋巴結(jié)清掃術(shù),患者接受了6個(gè)周期的環(huán)磷酰胺、甲氨蝶呤和氟尿嘧啶(CMF)輔助化療(CT),隨后進(jìn)行了全乳放射治療,并接受了為期3年的他莫昔芬治療,因副作用而暫停。
圖1:患者家族史調(diào)查表。 疾病命名采用國(guó)際命名法規(guī)則進(jìn)行
2019 年 12 月,由于繼發(fā)性同側(cè)原位導(dǎo)管癌(3 級(jí),HR 陽(yáng)性),進(jìn)行了同側(cè)乳房切除術(shù)。 患者拒絕進(jìn)一步的輔助治療。 2020年12月,患者感受到新出現(xiàn)的腹痛。 CT 掃描顯示腋窩淋巴結(jié)腫大和多發(fā)性肝轉(zhuǎn)移。 淋巴結(jié)活檢證實(shí)存在 HR 陽(yáng)性和 HER2 陰性的乳腺癌 (BC)反復(fù)。 考慮到患者有 7 年的無(wú)治療間隔且無(wú)內(nèi)臟危象標(biāo)準(zhǔn),一線治療選擇為來(lái)曲唑加 abemaciclib。 2021年4月,經(jīng)過(guò)4個(gè)月的治療,觀察淋巴結(jié)反應(yīng)和肝病進(jìn)展情況。 考慮到根據(jù)歐洲腫瘤學(xué)院-歐洲腫瘤內(nèi)科學(xué)會(huì) (ESO-ESMO) 2016 年共識(shí)指南觀察到的原發(fā)性激素耐藥,以及快速的內(nèi)臟進(jìn)展,選擇多西他賽加卡培他濱聯(lián)合化療。 該臨床病例經(jīng)分子腫瘤委員會(huì) (MTB)討論,并提出了兩項(xiàng)正式建議:通過(guò)免疫組織化學(xué) (IHC) 進(jìn)行肝活檢以重新測(cè)試 HR 和 HER2 狀態(tài),以及使用基于下一代測(cè)序 (NGS)的腫瘤靶向藥物基因檢測(cè)850對(duì)其進(jìn)行基因檢測(cè)。 肝臟樣本 (LEICA BOND MAX®) 中的 IHC 檢測(cè)顯示存在高雌激素受體表達(dá) (70%),不存在孕激素受體和 HER2 染色。 PIK3CA 基因 (LRG_310t1)采用基因檢測(cè)試劑盒分析11 種常見(jiàn)突變的定性分析,檢測(cè)位點(diǎn)包括H1047R、H1047Y y H1047L、E542K、E545K、E545D、E545A、E545G、Q546R ,外顯子 9 中的 Q546E 和外顯子 7 中的 C420R。采用基因檢測(cè)試劑盒未發(fā)現(xiàn)體細(xì)胞遺傳改變。 2021 年 6 月,經(jīng)過(guò)兩個(gè)周期的化療后,患者出現(xiàn)了新的肝病進(jìn)展。 當(dāng)時(shí),使用基于下一代測(cè)序基因檢測(cè)檢測(cè)表明 BRCA2 基因中存在致病變異 N588fs*26。 表 1 詳述了更多基因檢測(cè)結(jié)果。
表1:基于NGS的腫瘤正確用藥850基因檢測(cè)
基因代碼 | 基因突變對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的影響 | VAF | CNA |
---|---|---|---|
BRCA2 | N588ffs*26 | 26.78% | — |
KRAS | G12R | 23.51% | — |
ESR1 | Amplification-equivocal | — | 6 |
MCL1 | E110del | 57.21% | — |
RB1 | L220fs*3 | 24.94% | — |
TP53 | E224D | 38.23% | — |
考慮到患者的臨床病程和多基因檢測(cè)包的結(jié)果,MTB 第二次會(huì)議討論建議進(jìn)行腫瘤靶向藥物基因檢測(cè)850的遺傳咨詢,并開(kāi)始使用他拉唑帕尼進(jìn)行全身治療。 遺傳咨詢后,進(jìn)行了 33 個(gè)基因組,包括與結(jié)腸癌、婦科癌和結(jié)直腸癌相關(guān)的基因(APC、ATM、AXIN2、BARD1、BMPR1A、BRCA1、BRCA2、BRIP1、 CDH1、CHEK2、DICER1、EPCAM、GREM1、MLH1、MSH2、MSH3、MSH6、MUTYH、NBN、NF1、NTHL1、PALB2、PMS2、POLD1、POLE、PTEN、RAD50、RAD51C、RAD51D、SMAD4、SMARCA4、STK11、TP53)的基因檢測(cè)。在所有檢測(cè)的基因中沒(méi)有任何一個(gè)被發(fā)現(xiàn)任何相關(guān)的突變或變異。 2021 年 9 月,經(jīng)過(guò) talazoparib 治療 3 個(gè)月后,觀察到腹痛和肝臟部分反應(yīng)的臨床改善。 在提交本病例時(shí)(2021 年 12 月),腫瘤反應(yīng)正在進(jìn)行中。 圖 2 描繪了患者主要放射學(xué)發(fā)現(xiàn)的總結(jié),圖 3 描繪了患者演變的時(shí)間表。
圖 3:患者的主要治療及其結(jié)果時(shí)間表
晚期乳腺癌正確用藥基因檢測(cè)病例討論
NGS 已被證明是了解癌癥相關(guān)生物學(xué)途徑的關(guān)鍵實(shí)施。 在日常實(shí)踐中,體細(xì)胞和種系突變的鑒定使醫(yī)生能夠收集相關(guān)信息來(lái)做出治療決策并使患者受益。 重要的是,體細(xì)胞突變?yōu)橹委熖峁┝擞嗅槍?duì)性的機(jī)會(huì),并揭示了了解患者進(jìn)化的耐藥機(jī)制。 在腫瘤正確用藥基因檢測(cè)大數(shù)據(jù)分析中,在近 10% 的腫瘤樣本中觀察到 BRCA1/2 (sBRCA1/2m) 的體細(xì)胞突變和其他同源重組相關(guān)基因 (HRRG) 的改變。 晚期乳腺癌正確用藥基因檢測(cè)收錄的這一案例反映了一名患者對(duì) HR+/HER2- ABC 的經(jīng)典治療策略反應(yīng)不佳,NGS 導(dǎo)致發(fā)現(xiàn) sBRCA1/2m。 關(guān)于 PARPi 在 ABC 中致病性或可能致病性 sBRCA1/2m 和/或種系或體細(xì)胞 HRRG 突變 (g/sHRRGm) 中的效用,臨床試驗(yàn)和現(xiàn)實(shí)世界環(huán)境中的數(shù)據(jù)很少。 腫瘤正確用藥基因檢測(cè)研究組織在一項(xiàng)單組 II 期研究中評(píng)估了奧拉帕尼在 HER2 陰性 ABC 患者中的療效,其中 sBRCA1/2m 或 g/sHRRGm 不是 BRCA1/2。 在 16 名患有 sBRCA1/2 的患者組中,客觀緩解率 (ORR) 為 50%,中位無(wú)進(jìn)展生存期 (PFS) 為 6.3 個(gè)月(90% 置信區(qū)間 (CI),4.4 個(gè)月-不可用). 在與 gPALB2 突變相關(guān)的亞組中,ORR 為 82%,中位 PFS 為 13.3 個(gè)月(90% CI,12 個(gè)月-不可用)。 在僅具有 ATM 或 CHEK2 突變的患者中未觀察到反應(yīng)。佳學(xué)基因病案集收錄的另一項(xiàng) II 期研究中,他拉唑帕利對(duì) g/sHRRGm 乳腺癌和非乳腺癌患者的療效。 包括 13 名 ABC 患者。 基因解碼觀察到這種治療的總 ORR 為 25%,臨床獲益率為 50%。
腫瘤突變分析可能具有種系影響。 特別是,佳學(xué)基因一項(xiàng)對(duì)來(lái)自 302 名患者中 161 名的組織樣本的亞組分析表明,gBRCAm 和 tBRCAm 之間的一致性為 99%。
在一項(xiàng)回顧性系列研究中,腫瘤致病基因鑒定基因解碼及靶向藥物使用基因檢測(cè)確定 221 名患者至少有一種致病性或可能致病性 sBRCA1/2 改變。 其中 65% 接受了種系基因檢測(cè)。 共有 49% 的評(píng)估患者攜帶 gBRCA1/2m。 在這種情況下,應(yīng)該強(qiáng)調(diào)的是,國(guó)家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò) (NCCN) 指南建議對(duì)任何發(fā)現(xiàn) sBRCA1/2 的患者進(jìn)行驗(yàn)證性種系基因檢測(cè),而不需要參照腫瘤類(lèi)型。
腫瘤致病基因鑒定及惡化轉(zhuǎn)移分析項(xiàng)目組進(jìn)行了一項(xiàng)多中心前瞻性和觀察性研究,使用包含80個(gè)基因的基因檢測(cè)包評(píng)估了 2,984 名患者隊(duì)列中種系突變的發(fā)生率。 腫瘤基因解碼得出結(jié)論,大約八分之一的診斷為乳腺癌(BC)的患者具有與預(yù)后不良相關(guān)的遺傳變異,并且在近三分之一的參與者中,擬議的治療策略根據(jù) NGS 結(jié)果進(jìn)行了修改。 根據(jù)這一標(biāo)準(zhǔn)并與我們案例中執(zhí)行的診斷序列形成對(duì)比,基于腫瘤正確用藥850的基因檢測(cè)結(jié)果中,對(duì)種系遺傳評(píng)估應(yīng)該是調(diào)查可能的預(yù)后和預(yù)測(cè)因素的第一步。
其他研究評(píng)估了體細(xì)胞基因測(cè)序?qū)Υ龠M(jìn)臨床試驗(yàn)注冊(cè)和確定靶向治療方法的影響。
在 SAFIR-01 研究中,André 等人通過(guò)全面的基因組雜交和 Sanger 測(cè)序檢查了 PIK3CA 和 AKT1 突變的發(fā)生率,以及 423 名乳腺癌(BC)患者隊(duì)列中的其他藥物擴(kuò)增。 在具有可評(píng)估結(jié)果的 297 名患者中,46% 有基因組改變,其中 PI3KCA 突變 (25%) 和 CCND1 (19%) 和 FGFR1 (13%) 擴(kuò)增是最常見(jiàn)的發(fā)現(xiàn)。 向 13% 的研究參與者提供了有針對(duì)性的方法。 ORR 僅在隊(duì)列中的四個(gè)人中觀察到。
不同腫瘤模型中體細(xì)胞靶向改變的證據(jù)促使國(guó)際社會(huì)評(píng)估不同治療方案的體細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的適應(yīng)癥。 ESMO 指南已確定,不應(yīng)為 ABC 患者常規(guī)提供多基因測(cè)序。
基于NGS腫瘤正確用藥850基因檢測(cè)廣泛獲取大量的基因信息,盡管管這些信息對(duì)某些機(jī)構(gòu)的多學(xué)科團(tuán)隊(duì)形成結(jié)果解釋方面的挑戰(zhàn)。 但是結(jié)合這一水平的基因測(cè)序結(jié)果,加上初步臨床或臨床前證據(jù),區(qū)分代表已證實(shí)或潛在相關(guān)改變的發(fā)現(xiàn)。
歐洲腫瘤內(nèi)科學(xué)會(huì) (ESMO) 提出了 ESMO 分子靶點(diǎn)臨床可操作性量表 (ESCAT) 量表,它提供了一個(gè)系統(tǒng)框架,用于根據(jù)支持分子靶點(diǎn)作為治療靶點(diǎn)價(jià)值的現(xiàn)有證據(jù)對(duì)分子靶點(diǎn)進(jìn)行排序。 它允許通過(guò)改進(jìn)對(duì) NGS 發(fā)現(xiàn)的解釋來(lái)確定癌癥基因組改變的優(yōu)先級(jí)。 如果多種腫瘤類(lèi)型的臨床試驗(yàn)或聯(lián)合臨床試驗(yàn)已證明對(duì)特定腫瘤類(lèi)型具有臨床意義的益處,則結(jié)果被歸類(lèi)為“I-C 級(jí)”。
為得出這一結(jié)論,作者根據(jù)可操作性(ESCAT 量表)對(duì)這一人群中常見(jiàn)的體細(xì)胞改變進(jìn)行了分類(lèi)。 考慮到臨床獲益主要在其他腫瘤模型中觀察到,BRCA1/2 體細(xì)胞突變被歸類(lèi)為 ESCAT III。
在最近發(fā)表的臨床試驗(yàn) SAFIR-02 中,André 等人介紹了 238 名患者的結(jié)果,這些患者在晚期乳腺癌(ABC)化療后具有臨床獲益,并被隨機(jī)分配到 NGS 突變匹配靶向治療或繼續(xù)維持化療。 在 115 名患有 ESCAT I 或 II 突變腫瘤(與已證實(shí)或可能預(yù)測(cè)獲益相關(guān))的患者亞組中,接受靶向治療的手臂的 PFS 顯著延長(zhǎng)(分別為 9.1 個(gè)月和 2.8 個(gè)月)。 具體而言,在 HRD 評(píng)分等于或超過(guò) 42 的腫瘤病例中,靶向治療的 PFS 為 10.2 個(gè)月,而在接受維持化療的患者中觀察到的中位 PFS 為 2.7 個(gè)月。
這里介紹的案例提出了何時(shí)應(yīng)考慮 NGS 的問(wèn)題。 在這種情況下,MTB 的作用至關(guān)重要。 為了說(shuō)明這一點(diǎn),Hlevnjak 等人報(bào)告了前 200 名接受 DNA 或 RNA 全基因組或轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的晚期乳腺癌患者的經(jīng)歷(CATCH 研究)。 在 MTB 中討論的 128 個(gè)病人和 64 個(gè)案例 (50%) 中,根據(jù) MTB 的建議進(jìn)行了治療。 與 MOSCATO-01 研究相比,與之前的治療策略 PFS 相比,這些患者中有 30% 的 PFS 提高了 1.3 倍。
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