【佳學(xué)基因檢測】如何基因檢測自噬過程的物質(zhì)是否有基因突變？

佳學(xué)基因解碼自噬現(xiàn)象

自噬人體日?；顒又袝r刻發(fā)生的一下正常現(xiàn)象。其異常發(fā)生是人體多種疾病的基礎(chǔ)。目前，還沒有基因檢測可以正確檢測自噬過程的基因突變。因?yàn)闆]有這樣的數(shù)據(jù)庫建立。但是采用基因解碼是可以鑒定患者中的基因突變是否會影響人體的生理過程。

根據(jù)《人體生理過程的基因解碼》，自噬是指將細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞外成分輸送到動物細(xì)胞的溶酶體或植物或酵母細(xì)胞的液泡中的過程。自噬過程中產(chǎn)生的一個細(xì)胞器在《人體的基因序列變化與人體疾病表征》中被叫做自噬體。自噬體的產(chǎn)生和成熟直接受位置、時間和強(qiáng)度的調(diào)節(jié)。磷脂酰肌醇結(jié)合蛋白HS1BP3是自噬體生物發(fā)生的負(fù)調(diào)節(jié)因子，調(diào)節(jié)自噬體前體膜的脂質(zhì)成分和磷脂酸（PA）水平。據(jù)基因解碼結(jié)果，秀麗隱桿線蟲體內(nèi)的系統(tǒng)性自噬水平增加，激素性熱應(yīng)激和熱休克反應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子（HSF-1）誘導(dǎo)自噬以改善蠕蟲的存活和蛋白質(zhì)穩(wěn)定。此外，基因解碼還發(fā)現(xiàn)，自噬通過組蛋白（輔激活子相關(guān)）精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶CARM1的表觀遺傳調(diào)節(jié)進(jìn)行微調(diào)，CARM1是繼組蛋白H3R17二甲基化（組蛋白H3在精氨酸17處甲基化）之后的一種新酶，是饑餓誘導(dǎo)自噬的一個重要表觀遺傳標(biāo)記。此外，維生素D受體可調(diào)節(jié)正常乳腺和腔型乳腺癌細(xì)胞的自噬，表明維生素D水平與乳腺癌風(fēng)險之間存在潛在的治療聯(lián)系。腫瘤850正確用藥基因解碼中，包含了與自噬過程及維生素D的吸收和應(yīng)用有關(guān)的基因。還有許多其他調(diào)節(jié)自噬的內(nèi)源性和外源性因素，如轉(zhuǎn)錄因子、各種細(xì)胞質(zhì)生化物質(zhì)數(shù)量或濃度的變化、受損的細(xì)胞器、外源化合物和病原體；因此，自噬機(jī)制各不相同，不同的基因發(fā)生突變也會對自噬過程有不同的影響。根據(jù)細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)進(jìn)入溶酶體降解的機(jī)制以及靶向溶酶體底物的分子結(jié)構(gòu)，自噬可分為巨噬細(xì)胞自噬、微自噬和CMA。盡管這些途徑在機(jī)制上不同，但它們都通過溶酶體進(jìn)行降解。大多數(shù)形式的選擇性自噬涉及特定靶點(diǎn)的降解；例如，有絲分裂吞噬（線粒體）、嗜中性粒細(xì)胞吞噬（過氧化物酶體）、嗜酸性粒細(xì)胞吞噬（蛋白質(zhì)聚集體）、嗜糖（糖原）、嗜脂（脂質(zhì)）、嗜核糖體（核糖體）、嗜異種（病原體）和嗜內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。自噬是真核生物起始因子2（eIF2α）激酶途徑的一種新的、進(jìn)化上保守的功能，它由一個進(jìn)化上保守的絲氨酸/蘇氨酸激酶家族組成，調(diào)節(jié)應(yīng)激誘導(dǎo)的翻譯阻滯，并成為毒力基因產(chǎn)物的作用靶點(diǎn)。
 

巨自噬

當(dāng)含有細(xì)胞器的細(xì)胞質(zhì)的一部分被隔離形成自噬體時，巨自噬過程開始。自噬體與溶酶體或晚期內(nèi)體多泡體（MVB）融合，降解其中的物質(zhì)。Atg8（微管相關(guān)蛋白1A/1B輕鏈3，LC3，是人類的Atg8同系物）是先進(jìn)個經(jīng)過基因解碼過程被鑒定的自噬體蛋白。宏自噬可分為貨物特異性或非選擇性兩種形式。

當(dāng)不可發(fā)酵碳源和可發(fā)酵碳源（如葡萄糖）發(fā)生變化時，酵母中觀察到有絲分裂吞噬作用，隨后多余的線粒體群體經(jīng)歷有絲分裂吞噬。先進(jìn)個在酵母中引起線粒體吞噬的蛋白質(zhì)是SUN家族的成員Uth1p，它存在于線粒體外膜中，并允許在饑餓期間去除過多的線粒體[125]。線粒體外膜蛋白Atg32是選擇性自噬的受體，在哺乳動物物種中并不保守；相反，F(xiàn)UNDC1和BNIP3、BNIP3L/NIX和SQSTM1/p62作為線粒自噬的吞噬受體，分別依賴于缺氧、紅細(xì)胞成熟和損傷誘導(dǎo)的線粒體吞噬。當(dāng)真菌培養(yǎng)基從油酸或甲醇轉(zhuǎn)換為葡萄糖或氮饑餓培養(yǎng)基時，釀酒酵母和畢赤酵母也分別通過Atg36和PpAtg30受體誘導(dǎo)自噬過程。饑餓也被證明會誘導(dǎo)非選擇性巨自噬，而線粒體磷脂已被證明是自噬所必需的。利用酵母細(xì)胞對選擇性自噬所需的機(jī)制進(jìn)行了廣泛的研究，發(fā)現(xiàn)細(xì)胞質(zhì)-液泡靶向（CVT）途徑用于將液泡水解酶特異性地運(yùn)輸?shù)窖恐辰湍讣?xì)胞的液泡中。在哺乳動物自噬過程中，起始膜（吞噬細(xì)胞或隔離膜）的高度彎曲是CVT囊泡的一個顯著特征。