【佳學(xué)基因檢測】怎樣選擇多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼、基因檢測?
遺傳病、罕見病基因檢測導(dǎo)讀:
多發(fā)性骨髓瘤抗性是英文Multiple myeloma, resistance to的中文翻譯。多發(fā)性骨髓瘤 (MM) 是僅次于非霍奇金淋巴瘤的第二大常見血液系統(tǒng)惡性腫瘤。 癌細(xì)胞對標(biāo)準(zhǔn)藥物的內(nèi)在和獲得性耐藥性是現(xiàn)代臨床方案治療的多發(fā)性骨髓瘤患者獲得更成功生存結(jié)果的主要障礙。 佳學(xué)基因關(guān)于“多發(fā)性骨髓瘤的藥物靶點和耐藥機(jī)制”的關(guān)注的主要目的是收集關(guān)于多發(fā)性骨髓瘤耐藥機(jī)制和腫瘤微環(huán)境在治療失敗中的作用的新見解的新的和變革性信息??梢酝ㄟ^基因檢測了解多發(fā)性骨髓瘤抗性產(chǎn)生的原因及更有效果的治療方案。根據(jù)《人的基因序列變化與人體疾病表征》,該臨床征狀歸屬于血液腫瘤基因檢測。
什么樣的人應(yīng)當(dāng)做多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼、基因檢測?
多發(fā)性骨髓瘤是第二常見的血液惡性腫瘤。 盡管治療取得了重大進(jìn)展,但反復(fù)很常見且預(yù)后不良。 因此,闡明導(dǎo)致疾病進(jìn)展和耐藥性的遺傳因素至關(guān)重要。便利及可及的基因檢測有可能為出現(xiàn)這種不利情況后提供更新的解決方案。多發(fā)性骨髓瘤抗藥性基因解碼基因檢測對511 名反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤 (RRMM) 患者進(jìn)行了綜合臨床測序,以確定該疾病的分子改變圖譜。 NF-κB 和 RAS/MAPK 通路的改變比之前報道的更普遍,各有 45-65% 的發(fā)生率。 在 RAS/MAPK 通路中,存在與 RASopathies 相關(guān)的長尾變異。 通過將反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤病例與未經(jīng)治療的患者進(jìn)行比較,多發(fā)性骨髓瘤抗藥性基因解碼基因檢測發(fā)現(xiàn)一組不同的基因突變導(dǎo)致受研究的患者中有22% 的人對三種主要類型的靶向治療產(chǎn)生耐藥性。 IL6ST 中的激活突變也在反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤中富集。 綜上所述,佳學(xué)基因檢測收集的這些科技數(shù)據(jù)可作為未來反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤生物學(xué)研究的資源,并可能為臨床診斷和治療提供信息。。
佳學(xué)基因多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼、基因檢測大數(shù)據(jù)分析
在排除接受同種異體干細(xì)胞移植 (allo-SCT) 或在 CD138 + 選擇后腫瘤純度較低 (<20%) 的患者后,基因解碼大數(shù)據(jù)分析組編制了一組 511 名具有綜合 1700 基因腫瘤/正常 DNA 的反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤患者的測序和全轉(zhuǎn)錄組測序基因檢測數(shù)據(jù)用于綜合分析。總體而言,反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤樣本由22 個學(xué)術(shù)醫(yī)療中心提供。該隊列由 53.3% 的男性和 46.7% 的女性組成。輕鏈類型統(tǒng)計包括 52.4% kappa、31.5% lambda 和 0.4% 雙克??;15.7% 沒有可用信息。CD138 + 選擇后,反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤隊列的平均腫瘤含量為 62%。對于每位患者,基因檢測研究團(tuán)隊對來自腫瘤的 DNA 進(jìn)行了靶向測序,并匹配正常樣本以識別體細(xì)胞和種系遺傳畸變。腫瘤和正常文庫的平均目標(biāo)覆蓋率分別為 655X 和 483X,這是一個有利于亞克隆評估的測序深度。除了一個腫瘤樣本外,所有樣本的 RNA 測序都是可用的,并通過捕獲轉(zhuǎn)錄組測序進(jìn)行,所獲得的測序數(shù)據(jù)平均有 44.5 M 匹配序列?;蚪獯a基因檢測的分析包括拷貝數(shù)改變 (CNA)、基因融合,并提供每個樣本的基因表達(dá)水平。截至 2020 年 8 月,從 dbGaP 下載了來自 CoMMpass 研究的 1108 個 NDMM 樣本的 FASTQ 文件,并使用相同的生物信息學(xué)管道進(jìn)行了分析,以促進(jìn)與反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤的比較。總共有 965 個完整的 CoMMpass 案例可用于下游綜合分析。
采用統(tǒng)計工具的集成方法來發(fā)現(xiàn)基于單核苷酸變異 (SNV) 和插入缺失的癌癥驅(qū)動因素,基因解碼確定了一組 43 個高置信度、顯著突變的基因。它們的生物學(xué)功能可分為以下幾類:(1)RAS-MAPK通路(KRAS、NRAS、BRAF、PTPN11、 N ??F1、IL6ST),(2)NF-κB通路(CYLD、TRAF3、TRAF2、NFKBIA、IRAK1) , (3) MYC 通路 ( MYC ,MAX,EP300,CREBBP,SP3),(4)細(xì)胞周期和 DNA 損傷檢查點(TP53,RB1,CDKN2C,CDKN1B,ATM,F(xiàn)GFR3,LATS2),(5)RNA 加工機(jī)器(DIS3,F(xiàn)AM46C,DDX3X,DDX5), (6) 表觀遺傳修飾因子和轉(zhuǎn)錄共激活因子/共抑制因子(KDM3B、SETD2、ARID1A、ARID2、MBD1、IDH1、BCORL1、ATAD2B),(7)B 淋巴細(xì)胞發(fā)育(PRDM1、SP140、UBR5、IRF4)和(8)可能因 MM 治療而獲得突變的基因(CRBN、CUL4B、NR3C1)。RRMM的平均突變率為3.43點突變/兆堿基。由于 APOBEC 突變過程,在 9.8% 的病例中觀察到超突變,在另外 2.7% 的病例中觀察到超突變。由于晚期患者存在循環(huán)腫瘤細(xì)胞 (CTC),在具有廣泛變異等位基因部分 (VAF) 的匹配正常測序文庫中也檢測到癌癥驅(qū)動基因的突變。
多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼如何幫助婚戀和二胎生育
反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤很難通過侵襲性疾病過程來治療腫瘤。該病的基因解碼研究代表了反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤遺傳學(xué)的綜合分析,并進(jìn)一步系統(tǒng)地比較了反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤和NDMM的遺傳圖變的綜合性圖譜。通過涵蓋體細(xì)胞突變、indels、拷貝數(shù)改變、基因融合、基因表達(dá)和異常表達(dá),基因解碼基因檢測證明大多數(shù)多發(fā)性骨髓瘤患者在NF-κB和RAS-MAPK通路中存在改變。
多發(fā)性骨髓瘤抗性的數(shù)據(jù)庫代碼
根據(jù)《人的基因序列變化與人體疾病表征》,多發(fā)性骨髓瘤抗性的數(shù)據(jù)庫代碼正在增定審核中,歡迎持續(xù)關(guān)注支持。
怎樣選擇多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼、基因檢測?
如果是為了驗證對導(dǎo)致病的基因位點的猜測,可以選擇基因檢測?;蚪獯a在檢測的基因信息量、分析解讀的方式方法上要明顯優(yōu)于基因檢測。如果是為了幫助診斷、找到病因、避免遺傳,專業(yè)人員強(qiáng)烈建議選擇基因解碼。
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