【佳學(xué)基因檢測(cè)】怎樣選擇多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼、基因檢測(cè)?
遺傳病、罕見(jiàn)病基因檢測(cè)導(dǎo)讀:
多發(fā)性骨髓瘤抗性是英文Multiple myeloma, resistance to的中文翻譯。多發(fā)性骨髓瘤 (MM) 是僅次于非霍奇金淋巴瘤的第二大常見(jiàn)血液系統(tǒng)惡性腫瘤。 癌細(xì)胞對(duì)標(biāo)準(zhǔn)藥物的內(nèi)在和獲得性耐藥性是現(xiàn)代臨床方案治療的多發(fā)性骨髓瘤患者獲得更成功生存結(jié)果的主要障礙。 佳學(xué)基因關(guān)于“多發(fā)性骨髓瘤的藥物靶點(diǎn)和耐藥機(jī)制”的關(guān)注的主要目的是收集關(guān)于多發(fā)性骨髓瘤耐藥機(jī)制和腫瘤微環(huán)境在治療失敗中的作用的新見(jiàn)解的新的和變革性信息??梢酝ㄟ^(guò)基因檢測(cè)了解多發(fā)性骨髓瘤抗性產(chǎn)生的原因及更有效果的治療方案。根據(jù)《人的基因序列變化與人體疾病表征》,該臨床征狀歸屬于血液腫瘤基因檢測(cè)。
什么樣的人應(yīng)當(dāng)做多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼、基因檢測(cè)?
多發(fā)性骨髓瘤是第二常見(jiàn)的血液惡性腫瘤。 盡管治療取得了重大進(jìn)展,但反復(fù)很常見(jiàn)且預(yù)后不良。 因此,闡明導(dǎo)致疾病進(jìn)展和耐藥性的遺傳因素至關(guān)重要。便利及可及的基因檢測(cè)有可能為出現(xiàn)這種不利情況后提供更新的解決方案。多發(fā)性骨髓瘤抗藥性基因解碼基因檢測(cè)對(duì)511 名反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤 (RRMM) 患者進(jìn)行了綜合臨床測(cè)序,以確定該疾病的分子改變圖譜。 NF-κB 和 RAS/MAPK 通路的改變比之前報(bào)道的更普遍,各有 45-65% 的發(fā)生率。 在 RAS/MAPK 通路中,存在與 RASopathies 相關(guān)的長(zhǎng)尾變異。 通過(guò)將反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤病例與未經(jīng)治療的患者進(jìn)行比較,多發(fā)性骨髓瘤抗藥性基因解碼基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn)一組不同的基因突變導(dǎo)致受研究的患者中有22% 的人對(duì)三種主要類型的靶向治療產(chǎn)生耐藥性。 IL6ST 中的激活突變也在反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤中富集。 綜上所述,佳學(xué)基因檢測(cè)收集的這些科技數(shù)據(jù)可作為未來(lái)反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤生物學(xué)研究的資源,并可能為臨床診斷和治療提供信息。。
佳學(xué)基因多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼、基因檢測(cè)大數(shù)據(jù)分析
在排除接受同種異體干細(xì)胞移植 (allo-SCT) 或在 CD138 + 選擇后腫瘤純度較低 (<20%) 的患者后,基因解碼大數(shù)據(jù)分析組編制了一組 511 名具有綜合 1700 基因腫瘤/正常 DNA 的反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤患者的測(cè)序和全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序基因檢測(cè)數(shù)據(jù)用于綜合分析??傮w而言,反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤樣本由22 個(gè)學(xué)術(shù)醫(yī)療中心提供。該隊(duì)列由 53.3% 的男性和 46.7% 的女性組成。輕鏈類型統(tǒng)計(jì)包括 52.4% kappa、31.5% lambda 和 0.4% 雙克?。?5.7% 沒(méi)有可用信息。CD138 + 選擇后,反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤隊(duì)列的平均腫瘤含量為 62%。對(duì)于每位患者,基因檢測(cè)研究團(tuán)隊(duì)對(duì)來(lái)自腫瘤的 DNA 進(jìn)行了靶向測(cè)序,并匹配正常樣本以識(shí)別體細(xì)胞和種系遺傳畸變。腫瘤和正常文庫(kù)的平均目標(biāo)覆蓋率分別為 655X 和 483X,這是一個(gè)有利于亞克隆評(píng)估的測(cè)序深度。除了一個(gè)腫瘤樣本外,所有樣本的 RNA 測(cè)序都是可用的,并通過(guò)捕獲轉(zhuǎn)錄組測(cè)序進(jìn)行,所獲得的測(cè)序數(shù)據(jù)平均有 44.5 M 匹配序列?;蚪獯a基因檢測(cè)的分析包括拷貝數(shù)改變 (CNA)、基因融合,并提供每個(gè)樣本的基因表達(dá)水平。截至 2020 年 8 月,從 dbGaP 下載了來(lái)自 CoMMpass 研究的 1108 個(gè) NDMM 樣本的 FASTQ 文件,并使用相同的生物信息學(xué)管道進(jìn)行了分析,以促進(jìn)與反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤的比較??偣灿?965 個(gè)完整的 CoMMpass 案例可用于下游綜合分析。
采用統(tǒng)計(jì)工具的集成方法來(lái)發(fā)現(xiàn)基于單核苷酸變異 (SNV) 和插入缺失的癌癥驅(qū)動(dòng)因素,基因解碼確定了一組 43 個(gè)高置信度、顯著突變的基因。它們的生物學(xué)功能可分為以下幾類:(1)RAS-MAPK通路(KRAS、NRAS、BRAF、PTPN11、 N ??F1、IL6ST),(2)NF-κB通路(CYLD、TRAF3、TRAF2、NFKBIA、IRAK1) , (3) MYC 通路 ( MYC ,MAX,EP300,CREBBP,SP3),(4)細(xì)胞周期和 DNA 損傷檢查點(diǎn)(TP53,RB1,CDKN2C,CDKN1B,ATM,F(xiàn)GFR3,LATS2),(5)RNA 加工機(jī)器(DIS3,F(xiàn)AM46C,DDX3X,DDX5), (6) 表觀遺傳修飾因子和轉(zhuǎn)錄共激活因子/共抑制因子(KDM3B、SETD2、ARID1A、ARID2、MBD1、IDH1、BCORL1、ATAD2B),(7)B 淋巴細(xì)胞發(fā)育(PRDM1、SP140、UBR5、IRF4)和(8)可能因 MM 治療而獲得突變的基因(CRBN、CUL4B、NR3C1)。RRMM的平均突變率為3.43點(diǎn)突變/兆堿基。由于 APOBEC 突變過(guò)程,在 9.8% 的病例中觀察到超突變,在另外 2.7% 的病例中觀察到超突變。由于晚期患者存在循環(huán)腫瘤細(xì)胞 (CTC),在具有廣泛變異等位基因部分 (VAF) 的匹配正常測(cè)序文庫(kù)中也檢測(cè)到癌癥驅(qū)動(dòng)基因的突變。
多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼如何幫助婚戀和二胎生育
反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤很難通過(guò)侵襲性疾病過(guò)程來(lái)治療腫瘤。該病的基因解碼研究代表了反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤遺傳學(xué)的綜合分析,并進(jìn)一步系統(tǒng)地比較了反復(fù)難治性多發(fā)性骨髓瘤和NDMM的遺傳圖變的綜合性圖譜。通過(guò)涵蓋體細(xì)胞突變、indels、拷貝數(shù)改變、基因融合、基因表達(dá)和異常表達(dá),基因解碼基因檢測(cè)證明大多數(shù)多發(fā)性骨髓瘤患者在NF-κB和RAS-MAPK通路中存在改變。
多發(fā)性骨髓瘤抗性的數(shù)據(jù)庫(kù)代碼
根據(jù)《人的基因序列變化與人體疾病表征》,多發(fā)性骨髓瘤抗性的數(shù)據(jù)庫(kù)代碼正在增定審核中,歡迎持續(xù)關(guān)注支持。
怎樣選擇多發(fā)性骨髓瘤抗性基因解碼、基因檢測(cè)?
如果是為了驗(yàn)證對(duì)導(dǎo)致病的基因位點(diǎn)的猜測(cè),可以選擇基因檢測(cè)。基因解碼在檢測(cè)的基因信息量、分析解讀的方式方法上要明顯優(yōu)于基因檢測(cè)。如果是為了幫助診斷、找到病因、避免遺傳,專業(yè)人員強(qiáng)烈建議選擇基因解碼。
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