【佳學(xué)基因檢測】怎么確定關(guān)節(jié)炎早期篩查基因檢測的基因列表?
骨關(guān)節(jié)炎基因檢測導(dǎo)讀:
根據(jù)《人的基因序列變化與人體疾病》表征,共有459個(gè)基因可能在骨關(guān)節(jié)炎中受到調(diào)控,其中以衰老和創(chuàng)傷后(手術(shù))模型賊為突出。143個(gè)基因?qū)顷P(guān)節(jié)炎的嚴(yán)重程度有影響,而這中間有98個(gè)(69%)受到多次調(diào)控。不同研究之間的一些差異存在差異,為解釋這些數(shù)據(jù)提供了經(jīng)驗(yàn)。佳學(xué)基因使用收集的數(shù)據(jù)做為骨關(guān)節(jié)炎基因解碼的基礎(chǔ),并進(jìn)一步擴(kuò)展《人類基因序列突變數(shù)據(jù)》庫中的骨關(guān)節(jié)炎相關(guān)基因突變序列。隨著骨關(guān)節(jié)炎早期篩查基因檢測的推廣,舊的數(shù)據(jù)會(huì)得到驗(yàn)證和否定,同時(shí)新的臨床表征和基因突變之間的關(guān)系會(huì)被建立,尤其是具有家族聚集性的骨關(guān)節(jié)炎致病基因鑒定基因解碼的使用將會(huì)提供確切的、可被驗(yàn)證的數(shù)據(jù)。這將進(jìn)一步增加骨關(guān)節(jié)炎藥物開發(fā)和治療的靶點(diǎn),從而推進(jìn)骨關(guān)節(jié)炎的正確治療。
骨關(guān)節(jié)炎(OA)是一種退行性關(guān)節(jié)疾病,全球約有3億多患者,常導(dǎo)致生活質(zhì)量下降和殘疾。盡管骨關(guān)節(jié)炎的發(fā)病率正在上升,佳學(xué)基因估計(jì)到2040年將有2億人(或六分之一)患有骨關(guān)節(jié)炎,但對骨關(guān)節(jié)炎發(fā)生和發(fā)展的微結(jié)構(gòu)和分子機(jī)制的深入理解仍處于起步階段。此外,這一領(lǐng)域缺乏足夠的進(jìn)展嚴(yán)重阻礙了骨關(guān)節(jié)炎通過基因檢測等其他方法進(jìn)行早期診斷、預(yù)防,也防礙了有效治療藥物研發(fā)。
膝關(guān)節(jié)是一個(gè)復(fù)雜的結(jié)構(gòu),由關(guān)節(jié)軟骨、滑膜、關(guān)節(jié)囊、半月板、軟骨下骨、髕下和髕上脂肪墊以及肌腱和韌帶等張力結(jié)締組織組成。關(guān)節(jié)軟骨是滑膜關(guān)節(jié)表面的結(jié)締組織,關(guān)節(jié)軟骨退行性性變是骨性關(guān)節(jié)炎的特征。這種類型的軟骨具有獨(dú)特的粘彈性特性,具有承受高循環(huán)載荷的非凡能力,但它也是無血管的,自我更新的潛力有限。它由致密的細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)和稀疏分布的軟骨細(xì)胞組成,軟骨細(xì)胞的形態(tài)和數(shù)量因關(guān)節(jié)軟骨內(nèi)的解剖位置而異。雖然不同的軟骨細(xì)胞形態(tài)在組織學(xué)上已被確認(rèn),但我們尚未確定軟骨細(xì)胞異質(zhì)性的分子特征,以進(jìn)一步了解證實(shí)健康關(guān)節(jié)中解特定轉(zhuǎn)錄物如何促進(jìn)軟骨發(fā)生的,以及不同細(xì)胞的變化如何介導(dǎo)骨關(guān)節(jié)炎病理過程的發(fā)生。
一些研究利用關(guān)節(jié)置換手術(shù)中獲得的人體組織樣本對關(guān)節(jié)軟骨/軟骨細(xì)胞進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄分析,但通常這些結(jié)果僅代表晚期骨關(guān)節(jié)炎軟骨,可能缺乏疾病病因的詳細(xì)信息。盡管這些研究對骨關(guān)節(jié)炎進(jìn)展中的分子機(jī)制有了新的認(rèn)識(shí),但對于從健康關(guān)節(jié)分離的軟骨細(xì)胞的分子結(jié)構(gòu)卻提供的信息有限。這些研究也無法區(qū)分早期和晚期與軟骨退變相關(guān)的分子變化。動(dòng)物模型被廣泛用于研究關(guān)節(jié)生物學(xué),為研究OA的早期階段和疾病進(jìn)展機(jī)制提供了獨(dú)特的機(jī)會(huì)。近年來,包括佳學(xué)基因在內(nèi)的一些研究小組已經(jīng)采用了大量組織RNA測序(RNA-seq)和微陣列等技術(shù)來研究導(dǎo)致小鼠骨關(guān)節(jié)炎發(fā)生的分子變化。然而,全關(guān)節(jié)基因表達(dá)譜不能提供任何關(guān)于細(xì)胞異質(zhì)性的信息,也不能區(qū)分細(xì)胞類型特異性變化和多種細(xì)胞類型中發(fā)生的轉(zhuǎn)錄變化。盡管有幾項(xiàng)研究試圖分析顯微解剖關(guān)節(jié)的特定成分,以獲得更多的“組織特異性”基因表達(dá)譜,但這類研究在技術(shù)上具有挑戰(zhàn)性,可能會(huì)產(chǎn)生被一些被相鄰組織污染的樣本。單細(xì)胞RNA測序(scRNA-seq)使我們能夠通過分析從復(fù)雜結(jié)構(gòu)(如膝關(guān)節(jié))純化的所有單個(gè)細(xì)胞中的基因表達(dá)來克服這些限制。這將反過來幫助我們了解由于疾病進(jìn)展而產(chǎn)生的不同細(xì)胞類型和亞型之間的分子差異,并將導(dǎo)致發(fā)現(xiàn)以前未知的細(xì)胞群、細(xì)胞類型特異性轉(zhuǎn)錄譜和導(dǎo)致骨關(guān)節(jié)炎演變的分子途徑。
從關(guān)節(jié)軟骨中分離軟骨細(xì)胞在技術(shù)上是有挑戰(zhàn)性的,因?yàn)檫@些細(xì)胞嵌在致密的纖維狀ECM中。在基因解碼過程中,我們成功地從創(chuàng)傷前后的成年小鼠膝關(guān)節(jié)分離出關(guān)節(jié)軟骨細(xì)胞,并用scRNA-seq分析其轉(zhuǎn)錄組。通過這種方法,我們鑒定了9個(gè)具有不同轉(zhuǎn)錄本特征的軟骨細(xì)胞亞群,并測定了損傷后7天內(nèi)這些亞群中損傷誘導(dǎo)的分子變化。此外,我們還比較了小鼠軟骨細(xì)胞亞型和從骨關(guān)節(jié)炎軟骨中獲得的人軟骨細(xì)胞,以評估骨關(guān)節(jié)炎動(dòng)物模型臨床前結(jié)果的跨物種應(yīng)用可能性。我們鑒定了六種小鼠軟骨細(xì)胞亞型,它們與人類亞型具有高度的分子保真度。這項(xiàng)研究使我們能夠闡明健康和損傷小鼠軟骨中關(guān)節(jié)軟骨細(xì)胞的異質(zhì)性,并用確定的標(biāo)記物鑒定幾種軟骨細(xì)胞亞型。在這些軟骨細(xì)胞中描述的損傷誘導(dǎo)的早期分子變化可能代表了新的治療靶點(diǎn),用于評估預(yù)防創(chuàng)傷后軟骨退變的治療干預(yù)措施。
根據(jù)《人的基因序列變化與人體疾病》表征,共有459個(gè)基因可能在骨關(guān)節(jié)炎中受到調(diào)控,其中以衰老和創(chuàng)傷后(手術(shù))模型賊為突出。143個(gè)基因?qū)顷P(guān)節(jié)炎的嚴(yán)重程度有影響,而這中間有98個(gè)(69%)受到多次調(diào)控。不同研究之間的一些差異存在差異,為解釋這些數(shù)據(jù)提供了經(jīng)驗(yàn)。佳學(xué)基因使用收集的數(shù)據(jù)做為骨關(guān)節(jié)炎基因解碼的基礎(chǔ),并進(jìn)一步擴(kuò)展《人類基因序列突變數(shù)據(jù)》庫中的骨關(guān)節(jié)炎相關(guān)基因突變序列。隨著骨關(guān)節(jié)炎早期篩查基因檢測的推廣,舊的數(shù)據(jù)會(huì)得到驗(yàn)證和否定,同時(shí)新的臨床表征和基因突變之間的關(guān)系會(huì)被建立,尤其是具有家族聚集性的骨關(guān)節(jié)炎致病基因鑒定基因解碼的使用將會(huì)提供確切的、可被驗(yàn)證的數(shù)據(jù)。這將進(jìn)一步增加骨關(guān)節(jié)炎藥物開發(fā)和治療的靶點(diǎn),從而推進(jìn)骨關(guān)節(jié)炎的正確治療。
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